Sebagai lembaga pendidikan STITQI seperti halnya perguruan tiinggi yang lain memiliki program pendidikan. Program tersebut meliputi Kegiatan Akademik dan Kegiatan Penunjang Akademik.
1. Kegiatan Akademik
| – | Pendaftaran mahasiswa baru | – | Seminar proposal | |
| – | Ujian masuk mahasiswa baru | – | Pembekalan PPLK II | |
| – | Pengumuman hasil ujian | – | Pelaksanaan PPLK II | |
| – | Masa Ta’aruf Mahasiswa / ospek | – | Ujian Munaqosyah | |
| – | Registrasi mahasiswa | – | Wisuda Sarjana | |
| – | Pengisian dan penyerahan KRS | – | Pelatihan Dosen-dosen | |
| – | Kuliah Iftitah | – | Penerbitan jurnal | |
| – | Kuliah aktif mahasiswa | – | Penulisan kitab daras | |
| – | Ujian tengah semester | – | Dies Natalis STITQI | |
| – | Ujian akhir semester |
B. Kegiatan Penunjang Akademik
| – | Pengelolaan administrasi secara profesional | – | Penelitian keagamaan dan kemasyarakatan | |
| – | Penambahan komputer / laptop | – | Pembinaan Tilawatil Qur’an | |
| – | Penambahan meja kerja | – | Pembinaan Tahfidh al Qur’an | |
| – | Penambahan sarana prasarana perkuliahan | – | Pembinaan Kitabah | |
| – | Penambahan koleksi buku perpustakaan | – | Membangun networking | |
| – | Jaringan internet | – | Pemilihan dosen dan mahasiswa teladan | |
| – | Program Desa Binaan | – | Studi banding | |
| – | Program Kecamatan binaan | – | Sosialisasi keberadaan STITQI melalui media |
